医学系是在原淮北煤炭卫校基础上经过资源整合而成的教学单位，现开设高级护理、人口与计划生育专业，其中高级护理为国家级紧缺人才培养基地。该系现有教师32人，其中高级职称教师14人，具有副教授资格教师5人，其中具有"双师"素质10人。高级护理专业就业率达到98%左右，人口与计划生育专业就业率达到92%左右，两专业就业前景广阔。